明末清初的农民战争,也在大九湖一带写下了浓墨重彩。李自成潼关兵败后,藏入神农架深山之中。张献忠也曾在神农架山地养精蓄锐。留下了八王寨、断缰坪、落步河、彩旗岭等诸多遗迹。李自成建立的大顺朝在清军入关后土崩瓦解,李自成的右营右果毅将军刘体纯,率数万残部转战回到他们熟悉的大九湖一带。后来,刘体纯受南明王朝招抚,被封为皖国公。为示其对南明皇帝朱由榔的忠诚,他在大九湖旁的驻扎地坪圲手植一棵榔树。如今这棵三百多岁的古树依然旺盛,高达30余米,胸围达到6米。人们把这个地方叫做“国公坪”。
被打散的郝摇旗、袁宗第各部相继到大九湖与刘体纯会合。据《房县志》记载,在十余年时间里,刘体纯和郝摇旗曾三次率兵攻破房县城。后来,刘体纯攻打巫山县城时,伤重而亡,其部下将他葬于大九湖武墩子下的小河中间的岩包上,这条小河被叫做了“天子坟沟”。令人称奇的是无论暴发多么大的山洪,刘国公的墓地却从来没被淹没,水涨墓涨,水消自落。